Dr. Elnaz Amanzadeh
آخرین بروزرسانی: 1399/11/11
صفر تا صد تجزیه و تحلیل توالی ها ی ژنومی، آنالیز آماری بیان ژن و رسم نمودار در محیط پایتون
10 دانشجو
در این دوره ی آموزشی ۱۰ ساعته که پیشنهاد می شود طی ۵ هفته و به صورت هفته ای ۲ ساعت آموزش دیده و باقی هفته را به تمرین و بازبینی آموخته های خود بپردتزید، موارد زیر را می آموزید:
۱. اصول و مبانی کار با توالی های ژنومی با استفدا از دستور نویسی
۲. اصول ایجاد و مدیریت پروژه های ژنومی
۳. آنالیز اولیه توالی های ژنومی
۴. آمالیز آماری بیان‌ژنی و ترسیم‌نمودار
مقدمه
مدیریت فایل های ژنومی با استفاده از کدنویسی
- یافتن دایرکتوری ها
- Home Directory
- ایجاد دایرکتوری های جدید
- تهیه ی لیست فایل های ژنومی
- استفاده از flag ها برای Sorting فایل ها
- روش ترکیب دستورها
- استفاده از Text Editor ها برای خوانش فایل های ژنومی
- روش نقل و انتقال فایل ها با استفاده از کد نویسی
- حذف فایل ها و دایرکتوری های یک پروژه ی ژنومیکس
- جابجایی فایل ها و دایرکتوری ها
- روش Copy/Paste کردن فایل ها و دایرکتوری ها با استفاده از کد نویسی
- تفاوت انتقال و Copy کردن فایل ها
- روش ایجاد پایپ لاین
- ثبت خروجی اطلاعات توالی های ژنومی در یک فایل خروجی
تکرار یک دستور برای دهها فایل در پروژه ی ژنومیکس
اصول مدیریت پروژه ژنومیکس
آنالیز داده های حجیم با فرمت csv و tsv
روش دریافت داده از دیتابیس SRA
تمرینات
0 نظر
759 دانش آموزان
17 دورها
